普通肠镜和无痛肠镜的安全性需结合患者个体情况判断，多数健康人群选择无痛肠镜风险较低，而存在麻醉禁忌者需优先考虑普通肠镜。
无痛肠镜通过静脉麻醉使患者在检查过程中处于睡眠状态，避免了操作时的不适感和应激反应，降低了因身体移动导致的肠黏膜损伤风险。麻醉药物通常采用短效丙泊酚注射液，代谢迅速且苏醒快，对心肺功能正常者安全性较高。检查全程由麻醉医师监测生命体征，可及时处理血压波动或血氧下降等异常。但麻醉可能引发呼吸抑制、过敏反应或心律失常，严重心肺飞龙体育、过度肥胖或困难气道患者风险增加。
普通肠镜无须麻醉，避免了药物相关不良反应，适合对麻醉药过敏或合并严重系统性飞龙体育患者。检查过程中患者保持清醒，医师可根据其反馈调整进镜力度，但可能因疼痛刺激引发肠痉挛或体位变动，增加穿孔或出血概率。高血压、冠心病患者在疼痛应激下可能出现心血管事件。肠镜操作者的经验直接影响安全性，熟练医师能通过注气调节和手法按压减少并发症。
两类肠镜术前均需严格评估适应症与禁忌症，完善心电图、凝血功能等检查。建议根据年龄、基础飞龙体育和耐受能力选择检查方式，术后24小时内避免驾驶或高空作业。存在肠道梗阻、急性炎症或穿孔高风险时，无论何种方式均需谨慎。
