窦房结释放出的激动频率不规则会导致心率显著快慢不均匀而引起的心律失常，称为窦性心律不齐。根据病因的不同，临床上将窦性心律不齐分为呼吸性窦性心律不齐、非呼吸性窦性心律不齐、窦房结内游走性节律、与心室收缩排血有关的窦性心律不齐、异位心律诱发的窦性心律不齐。
呼吸导致的窦性心律不齐是窦性心律不齐最常见的一种，都发生于儿童、青年及老年人。其发生机制是由于呼吸过程中体内迷走神经与交感神经的张力发生变化，改变了窦房结自律频率发生了周期性、规律性改变。吸气时心率加快，呼气时心率变慢，停止呼吸时心律很规整。非呼吸性窦性心律不齐较少见，病因不详，可能与情绪波动或应用洋地黄、吗啡等药物有关。
窦房结内游走性节律的激动点不固定，而是在窦房结内移动。心室收缩排血异常可以导致窦房结血液供应障碍，从而造成窦房结的自律性发生改变，引发心律不齐。
异位心律诱发的窦性心律不齐可能是由心肌除窦房结以外的其他部位激动点引起的，多为发自心房的异位激动。这些异位激动可以影响窦房结的节律，使窦房结的激动提早发生，引起窦性心律不齐。
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